近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所王力榮團(tuán)隊與華中農(nóng)業(yè)大學(xué)郭文武教授、美國康奈爾大學(xué)BoyceThompson研究所費章君教授合作完成了基于480份桃全基因組重測序解析桃育種歷史的研究成果。該研究揭示了桃馴化和改良的基因組印記,闡明了桃果實大小和風(fēng)味性狀的分子演化機(jī)制,為桃全基因組選擇育種提供了支撐。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《基因組生物學(xué)(GenomeBiology)》上。
桃起源于我國,種質(zhì)資源豐富。該研究團(tuán)隊對480份野生和栽培桃樣本進(jìn)行了全基因組重測序,涵蓋了國家桃種質(zhì)圃(鄭州)1410份種質(zhì)95%以上的遺傳多樣性,構(gòu)建了迄今為止世界上*的桃變異組數(shù)據(jù)庫。利用變異組數(shù)據(jù),研究團(tuán)隊對11個重要農(nóng)藝性狀進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)了多個新位點,為分子標(biāo)記的開發(fā)和分子育種提供了材料。
野生桃經(jīng)過馴化和改良階段的進(jìn)化,果實外觀、大小和品種均發(fā)生了劇烈變化。通過比較基因組學(xué),該研究闡明了桃馴化和改良中人工選擇的基因組區(qū)段,揭示了桃如何由野生狀態(tài)進(jìn)化成為現(xiàn)今栽培狀態(tài)的分子機(jī)制。研究發(fā)現(xiàn),桃果實大小的增加主要發(fā)生在馴化階段,而果實風(fēng)味相關(guān)的位點在馴化和改良階段均受到強(qiáng)烈選擇作用,但改良階段選擇的位點數(shù)目更多;苦澀味相關(guān)位點在馴化中基本已經(jīng)丟失。另外,該研究還鑒定了低需冷量育種的目標(biāo)區(qū)段,發(fā)現(xiàn)東方、西方桃改良階段約50%的受選擇基因組區(qū)段不同,從基因組層面解析了需冷量、肉質(zhì)和風(fēng)味相關(guān)基因的演化規(guī)律。該研究采用目前*規(guī)模的桃重測序全面揭示了桃進(jìn)化的遺傳機(jī)制,為后續(xù)桃遺傳演化和分子生物學(xué)研究提供了有力支撐。
該研究是王力榮團(tuán)隊“千份桃基因組計劃”繼2014年和2016年取得重要進(jìn)展后的又一重要成果,系統(tǒng)全面解析了人工選擇對桃基因組的修飾,為后續(xù)桃分子設(shè)計育種提供了重要依據(jù),后續(xù)相關(guān)工作仍在開展中。
該研究得到了國家自然基金面上項目、中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程和作物種質(zhì)資源保護(hù)項目的資助。
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